Die Orgel in Nienborg hat 32 Register, die auf drei Manuale (I Hauptwerk, II Schwellwerk, III Oberwerk) und Pedal verteilt sind. Es handelt sich um eine elktro-pneumatische Orgel aus den 1950er Jahren, die mehrfach umgebaut wurde. Zuletzt wurde das Instrument im Jahr 2009 von der Firma Stockmann gereinigt und neu intoniert. Folgende Spielhilfen sind vorhanden: Koppeln II/I, III/I, III/II, I/P, II/P, III/P, Handregister, 3 freie Kombinationen, 2 freie Pedalkombinationen, Walze.